Стыдно признаться, но я только сейчас разобрался с тем, как работать с видео 16:9. Долго не мог понять почему в After Effects видеофайлы снятые в формате 16:9 открываются в сжатом виде 3:4. От этого, естественно, все лица и предметы были вытянутыми.

Не желая разбираться с этой проблемой, я даже пытался отказался от формата 16:9. Но недавно случайно наткнулся на очень простое решение проблемы. Оказалось дело всего-навсего в неправильном отображении. Для правильного отображения 16:9 есть специальная кнопка в окне композиции Toggle pixel aspect ratio correction.